每年进入9月份，就是国家、省、市、县（区）四级财政广泛征集申报第二年农业农村财政支持项目的集中时间段，积极稳妥的用足用好国家政策，借助财政资金的引导力量，可以帮助企业快速壮大、项目更好运行，取得显著的综合成效。
申请主体可以是高校、科研院所、农技推广服务机构、种养大户、家庭农场、农民专业合作社、农业产业化龙头企业、产业化联合体、产业联盟等，还可以是地方政府（如产业强镇）、主管部门（如食品安全监测）。经过精心谋划，每年争取2一3个财政项目支持，获得10一200万元财政支持是完全可行的，个别规模大些的项目如产业强镇、国家级现代农业园区可达到500一1000万元，且每年在各省都有大量这样的案例，这也是加快地方农业农村发展的重要环节。
申请财政支持项目必须与当年的国家大政方针保持高度一致，而且财政资金大多数时候充当的是锦上添花的功能，申请之前应充分调研分析自身需求，所投资的项目和实施的内容必须是主体本来就计划当中的经营动作，而不能是单纯为了申请财政支持而仓促包装上马不必要的项目，本末倒置，以免浪费。大多数情况下，以企业为申请主体的财政支持都要求有一定比例的自筹资金配套，而且在具体资金兑现时，大多采用先建后补的方式，因此，申请主体必须充分考虑项目建设资金的合理筹措和使用，规避项目建设风险。
项目申请大致可概括为三个环节，即“跑路子，编本子，要票子”。申请主体一定要与主管部门保持紧密沟通，及时了解国家政策方向、地方产业导向、申请指南要求，准确把握项目申请的条件和技巧。根据项目申请指南认真编制项目申请资料，如实提供项目证明附件，必要时还须准备好项目实施现场、实施条件、实施进度等供上级主管部门领导现场勘察核实。必须找对人，办对事，有耐心，严格按照项目申请指南编制申请文件，接受属地主管部门抽查监督和管理，按时完成网上申报、系统入库、纸质材料报送，组织人员答辩、答疑，积极组织人员实施项目才能够提高项目申请的成功率。
可申请的项目按照行政区划级别主要分为中央、省、市、县（区）四级。按照资金来源包括中央预算内、国拨、地方（省、市、县）配套、统筹、专项、特殊等。按照资金性质包括奖补、奖励、贴息、财政入股、专项债券、产业基金等。不同的资金使用范围、验收标准、绩效考核、风险回报都有不同的具体要求。
农业农村可申请的财政支持项目相对应的主管部门包括农业农村局、新农办、财政局、农综办、旅游局、科技局、林业局、发改委、工信局、商务局、乡村振兴局等。具体需要针对实际项目确定归口申请管理部门。此外，水利局、环保局、扶贫开发局、经贸局也有一些项目可供申请。项目申请有两种模式，一种是直接申请，财政支持，考核验收，一年回头看，三年巡视检查；一种是先申请入库，一般是次年再申请财政支持。
每年农业农村项目申请竞争十分激烈，每个项目从通知到申报截止时间都很短，因此要求申请主体未雨绸缪、提前沟通、提前准备，例如发改口项目一般要求具备项目备案立项、选址、规划、土地、环保、建设等前置手续，短时间内很难完成全部申请条件准备。所以，平时就应和主管对口部门保持良好沟通，从项目属地（乡镇、街道办、区县）、市、省、部逐渐推荐上报。科技口、工信口项目一般要求较高的技术含量和科研实力，申请主体需要提前与科研院校建立产学研合作关系，分工协作，共同完成。
企业申报农业项目的必备准备企业的法人证书、营业执照复印件、企业资产负债表、地方政府配套资金证明、土地使用证明或者土地租用合同、项目申请书、项目可行性研究报告、当地银行出具的信用等级证明、贷款证明、环评报告、企业获得荣誉证书、项目实施照片等。不同的项目，要求也不尽相同。
经营主体在申请农业综合开发项目资金时，具备的条件主要包括：一是申报单位有法人资格。二是经营期限两年以上，并且连续盈利，有一定的经营规模和实力，有较强的资金能力。三是近两年资金负债率小于或等于95%，银行信用等级A级以上。四是开发的产品科技含量高，市场潜力大，竞争优势明显（有资质单位编制的可研报告）。五是带动农民能力强，与农民建立紧密、合理的利益连接机制。六是建立了符合市场经济要求的经营机制。七是企业经济效益好，能够确保用款企业盈利归还财政有偿资金，也就是企业借资金后，能够获得盈利并归还贷款。有些项目还要求提供近三年的审计报告，近期的财务报告，项目建设用地批准文件，环保部门环境评价意见，专家对项目的初步评估意见等。
经营主体在申报农产品加工示范企业时，要求企业必须具备以下条件：以农产品加工(包括粮、油、果蔬、畜产品、水产品、特色农产品)为主业、具有独立法人资格的企业，农产品加工产品的年销售收入在5000万元以上，并占总销售收入的70%以上；近三年内无质量安全卫生事故；企业具有比较健全的质量管理与质量控制体系，通过ISO9000质量体系认证或HACCP认证；企业的总资产报酬率应高于同期银行贷款利率；企业资产负债率一般低于60%；企业银行信用等级在AA级以上；带动农户增收作用明显；企业从事农产品加工过程中，通过订立合同、入股和合作方式采购的国产原料占所需原料的75%以上(其中大豆国产原料使用比例为50%以上)；企业产品在同行业中居领先水平，原料综合利用率高，主管产品产销率达90%以上等。
科技部科技型中小企业技术创新基金投资额度一般是100万元以下(科技部规定80万元以上属国家重点科研项目，由国家科技部审批；80万元以下是一般项目，由各省科技厅审批即可)，且一般为无偿投资。资金由科技部管理，各企业通过所在地的县、市直接报到省。科技部星火计划项目，资金在20—60万元，一般企业申报成功率都很高。企业还可申请科技部农业科技成果转化资金。
省、市、区级科技专项一般都采取前期答辩、中期监理、后期验收的申请实施模式，大多数情况下，每年3月主管部门会广泛征集技术需求，9月发布申报指南，很大一部分项目都是前期已经定制好的，所以，申请主体前期工作需要进一步提前，平常多关注国家科技部、省科技厅、市县区科技局官网通知，第一时间对接项目申请工作。
国家级、省级、市级、县（区）级农业产业化龙头企业、各级现代农业园区、带动农户多的企业、科技含量高的企业、高效节能循环经济、乡村振兴主导产业企业相对获得财政支持项目的机会和可能性就比较大，围绕主导产业集群、一二三产业融合等项目更容易得到支持。